Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms