Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms