Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME5P56597 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME5P56597 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms