Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLH1P40692 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLH1P40692 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLH1P40692 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms