Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL15A1P39059 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL15A1P39059 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL15A1P39059 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL15A1P39059 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL15A1P39059 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL15A1P39059 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL15A1P39059 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL15A1P39059 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL15A1P39059 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms