Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD38P28907 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD38P28907 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD38P28907 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD38P28907 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD38P28907 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD38P28907 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD38P28907 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD38P28907 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms