Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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