Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDSP20132 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDSP20132 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDSP20132 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDSP20132 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDSP20132 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDSP20132 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDSP20132 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms