Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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