Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms