Protein–RNA interactions for Protein: P04430

IGKV1-16, Immunoglobulin kappa variable 1-16, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-16P04430 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-16P04430 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-16P04430 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms