Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIP1O00291 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms