Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms