Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms