Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms