Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms