Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-212ENST00000558655 2773 ntTSL 24.82□□□□□ -1.648e-7■■■■■ 178.5
UTP3Q9NQZ2 ABCA7-206ENST00000525073 1918 ntTSL 222.76■■□□□ 1.232e-9■■■■■ 178.4
UTP3Q9NQZ2 UBFD1-206ENST00000566669 577 ntTSL 229.23■■■□□ 2.273e-6■■■■■ 178.4
UTP3Q9NQZ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 178.4
UTP3Q9NQZ2 UBFD1-210ENST00000571064 794 ntTSL 322.99■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 178.4
UTP3Q9NQZ2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 178.4
UTP3Q9NQZ2 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 178.4
UTP3Q9NQZ2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.267e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 ASAP1-211ENST00000521075 5406 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.267e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 RECQL5-205ENST00000443199 3089 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 NAPA-205ENST00000594001 1417 ntTSL 217.98■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 NAPA-202ENST00000593761 891 ntTSL 517.68■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 NAPA-219ENST00000601208 989 ntTSL 516■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 NAPA-221ENST00000602082 894 ntTSL 1 (best)15.25■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 178.3
UTP3Q9NQZ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.733e-6■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.643e-6■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 ATG16L2-219ENST00000542908 1178 ntTSL 224.22■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 ATG16L2-202ENST00000435507 2254 ntTSL 223.56■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 ATG16L2-220ENST00000544490 3731 ntTSL 216.86■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 AGK-203ENST00000473247 1550 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 59.06□□□□□ -0.967e-7■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 525.98■■□□□ 1.756e-10■■■■■ 178.2
UTP3Q9NQZ2 TLN1-203ENST00000464379 814 ntTSL 314.48□□□□□ -0.099e-10■■■■■ 178.1
UTP3Q9NQZ2 EXOC4-204ENST00000460346 762 ntTSL 410.33□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 178.1
UTP3Q9NQZ2 SYMPK-212ENST00000598896 1899 ntTSL 1 (best)25.25■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 SYMPK-208ENST00000598059 611 ntTSL 422.56■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 SYMPK-205ENST00000594293 623 ntTSL 418.54■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 SYMPK-204ENST00000593959 546 ntTSL 417.38■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 SYMPK-218ENST00000602061 503 ntTSL 413.46□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 XRN1-213ENST00000489241 393 ntTSL 37.6□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 PIK3CB-202ENST00000461451 667 ntTSL 225.37■■□□□ 1.652e-15■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 PIK3CB-210ENST00000483968 721 ntTSL 323.89■■□□□ 1.412e-15■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN6-203ENST00000587009 1967 ntTSL 222.05■■□□□ 1.122e-13■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN6-206ENST00000590466 803 ntTSL 321.56■■□□□ 1.042e-13■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN6-207ENST00000591919 1613 ntTSL 519.89■□□□□ 0.772e-13■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN6-204ENST00000587324 712 ntTSL 319.72■□□□□ 0.752e-13■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-13■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN6-205ENST00000588238 4598 nt17.1■□□□□ 0.332e-13■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 PIK3CB-205ENST00000465581 690 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-15■■■■■ 177.9
UTP3Q9NQZ2 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 220.95■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 177.8
UTP3Q9NQZ2 BCR-207ENST00000463770 168 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 177.8
UTP3Q9NQZ2 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 177.8
UTP3Q9NQZ2 IST1-225ENST00000568581 503 ntTSL 515.81■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 177.8
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 177.7
UTP3Q9NQZ2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 177.7
UTP3Q9NQZ2 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 177.7
UTP3Q9NQZ2 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 177.7
UTP3Q9NQZ2 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 177.7
UTP3Q9NQZ2 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 177.7
UTP3Q9NQZ2 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 177.7
UTP3Q9NQZ2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.385e-22■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 DHX29-202ENST00000504778 4557 ntTSL 1 (best)15.34■□□□□ 0.055e-12■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.385e-12■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.745e-12■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.192e-8■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 511.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 177.5
UTP3Q9NQZ2 PTK2B-202ENST00000397497 3161 ntTSL 213.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 177.4
UTP3Q9NQZ2 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 177.4
UTP3Q9NQZ2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 177.4
UTP3Q9NQZ2 GALNT11-210ENST00000447778 1231 ntTSL 518.44■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 177.4
UTP3Q9NQZ2 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 177.4
UTP3Q9NQZ2 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 177.3
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-205ENST00000505616 402 ntTSL 211.27□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 177.2
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.648e-7■■■■■ 177.2
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 177.2
UTP3Q9NQZ2 PTMA-207ENST00000440384 222 ntTSL 320.39■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 177.2
UTP3Q9NQZ2 NOL4L-208ENST00000475781 1127 ntTSL 518.19■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 177.2
UTP3Q9NQZ2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 177.2
UTP3Q9NQZ2 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 177.2
UTP3Q9NQZ2 CERS2-203ENST00000361419 997 ntTSL 231.99■■■□□ 2.711e-6■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 CERS2-206ENST00000421609 738 ntTSL 327.08■■□□□ 1.931e-6■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.44e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 CERS2-207ENST00000457392 545 ntTSL 323.27■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.131e-12■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.133e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 TOLLIP-210ENST00000530506 1297 ntTSL 521.56■■□□□ 1.044e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 LINC-PINT-203ENST00000429901 565 ntTSL 420.78■□□□□ 0.926e-26■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 MKLN1-208ENST00000494286 582 ntTSL 419.59■□□□□ 0.737e-27■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 MKLN1-205ENST00000446815 551 ntTSL 419.08■□□□□ 0.647e-27■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 TOLLIP-211ENST00000530541 684 ntTSL 217.39■□□□□ 0.374e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 NFIX-212ENST00000590027 579 ntTSL 216.03■□□□□ 0.165e-12■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 ZNF644-211ENST00000498303 514 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -03e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 CERS2-204ENST00000368949 1002 ntTSL 515.03■□□□□ -01e-6■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 MKLN1-202ENST00000416992 864 ntTSL 39.86□□□□□ -0.837e-27■■■■■ 177
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