Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO1B3Q9NPD5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms