Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms