Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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