Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHP1Q99653 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms