Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms