Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERCC4Q92889 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms