Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms