Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms