Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms