Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms