Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms