Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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