Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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TRAF3Q13114 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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TRAF3Q13114 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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TRAF3Q13114 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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TRAF3Q13114 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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