Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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