Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms