Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms