Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms