Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms