Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED6P86452 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms