Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms