Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.417e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 SMYD3-212ENST00000483072 466 ntTSL 26.55□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CFAP44-201ENST00000295868 3377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CFAP44-210ENST00000488854 2410 ntTSL 56.34□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CFAP44-207ENST00000475568 554 ntTSL 42.55□□□□□ -21e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 APOC3-204ENST00000470144 269 ntTSL 59.78□□□□□ -0.841e-12■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RBM41-208ENST00000495517 3315 ntTSL 26.16□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.399e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.169e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 WIPF2-203ENST00000494757 2113 ntTSL 1 (best)20.45■□□□□ 0.869e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RNF8-201ENST00000229866 2124 ntTSL 219.97■□□□□ 0.799e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.729e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.669e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.659e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-202ENST00000505192 1693 ntTSL 218.44■□□□□ 0.549e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.479e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.479e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RAB10-204ENST00000495146 1292 ntTSL 517.09■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.299e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 DGKH-207ENST00000611224 777 ntTSL 216.48■□□□□ 0.239e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.169e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.129e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RERE-210ENST00000468247 414 ntTSL 215.75■□□□□ 0.119e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.079e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CCDC120-205ENST00000603906 2478 ntTSL 215.22■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.019e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-206ENST00000511227 2431 ntTSL 215.08■□□□□ 09e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.019e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.029e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 WIPF2-206ENST00000582781 3163 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.079e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.099e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 314.45□□□□□ -0.19e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 PANK2-205ENST00000495692 967 ntTSL 314.39□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.119e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ZNF215-208ENST00000636097 2150 ntTSL 514.33□□□□□ -0.119e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 GNPAT-202ENST00000416000 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.3□□□□□ -0.129e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMC6-211ENST00000589271 1099 ntTSL 514.28□□□□□ -0.129e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 UBXN7-206ENST00000493566 921 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMC6-210ENST00000588792 843 ntTSL 214.24□□□□□ -0.139e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 FTSJ1-206ENST00000473235 688 ntTSL 514.15□□□□□ -0.149e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 FTSJ1-211ENST00000490202 965 ntTSL 514.15□□□□□ -0.149e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 C21orf59-207ENST00000458138 863 ntTSL 314.05□□□□□ -0.169e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 GNPAT-203ENST00000436239 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.01□□□□□ -0.179e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 213.98□□□□□ -0.179e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.189e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-210ENST00000514336 583 ntTSL 313.87□□□□□ -0.199e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-211ENST00000514643 831 ntTSL 313.87□□□□□ -0.199e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-212ENST00000515429 546 ntTSL 413.87□□□□□ -0.199e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.199e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMPRSS4-202ENST00000517483 2074 ntTSL 213.82□□□□□ -0.29e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 AP2A1-206ENST00000600199 2381 ntTSL 513.75□□□□□ -0.219e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 FTSJ1-212ENST00000492562 610 ntTSL 313.59□□□□□ -0.239e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.269e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 DOCK9-214ENST00000479769 420 ntTSL 313.4□□□□□ -0.269e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.279e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMPRSS4-210ENST00000522151 692 ntTSL 313.35□□□□□ -0.279e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-204ENST00000505867 2401 ntTSL 213.3□□□□□ -0.289e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.299e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 PHLDB1-221ENST00000532639 748 ntTSL 512.97□□□□□ -0.339e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 HLA-DMA-206ENST00000464392 806 nt12.87□□□□□ -0.359e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ZNF215-209ENST00000636606 2204 ntTSL 512.69□□□□□ -0.389e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.389e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.389e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMC6-205ENST00000586126 821 ntTSL 312.6□□□□□ -0.399e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMC6-223ENST00000592594 551 ntTSL 412.57□□□□□ -0.49e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.419e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ZNF215-203ENST00000527171 1602 ntTSL 212.49□□□□□ -0.419e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-209ENST00000512801 736 ntTSL 312.47□□□□□ -0.419e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.429e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.439e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMPRSS4-207ENST00000519236 1934 ntTSL 212.33□□□□□ -0.449e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ZNF215-204ENST00000529755 1452 ntTSL 212.21□□□□□ -0.459e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.469e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMC6-207ENST00000586697 571 ntTSL 412□□□□□ -0.499e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 CCDC120-208ENST00000620388 2953 nt11.98□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ACAD9-203ENST00000505602 553 ntTSL 411.95□□□□□ -0.59e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 PHLDB1-228ENST00000621027 1318 ntTSL 211.86□□□□□ -0.519e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.529e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-11■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.529e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.539e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.539e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 FTSJ1-213ENST00000496365 1287 ntTSL 511.69□□□□□ -0.549e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.559e-6■■■■■ 27.7
PTBP1P26599 TMPRSS4-203ENST00000517544 789 ntTSL 311.64□□□□□ -0.559e-6■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 386.2 ms