Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms