Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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