Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLP19338 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLP19338 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLP19338 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms