Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms