Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms