Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms