Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCO2O43819 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCO2O43819 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms