Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms