Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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