Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms