Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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COMMD9Q9P000 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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COMMD9Q9P000 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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