Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXL2Q9NZ53 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms